FACTORES AMBIENTALES EN EL INTERIOR DEL TUBO VOLCÁNICO

     La temperatura general de la cueva se mantiene en torno a los 15º C, pero las fluctuaciones diarias y anuales son mayores en las galerías existentes entre las bocas que en los tubos ciegos. Ello es debido a que en las primeras se originan corrientes de aire una veces ascendentes y otras descendentes, según las condiciones metereólogicas del exterior, y se comportan por tanto como un típico tubo de viento.
      La humedad es muy alta en toda la cueva, con un goteo intenso que en algunos lugares prácticamente adquiere forma de lluvia, sin embargo no toda el agua que llega a la cueva lo hace de un modo natural sino que también proviene de los riegos de los cultivos superficiales. La cantidad de agua que llega a la cueva es tal que a veces puede apreciarse en su interior, la existencia de un ligero riachuelo que desemboca por la entrada inferior, donde es canalizada hasta un estanque próximo no obstante no creemos que se den casos de inundación en ningún momento.
Hemos analizado el agua por si en su composición pudiera apreciarse algún añadido químico o alguna proporción anómala de sus constituyentes que pudieran afectas a las especies cavernícolas los resultando quedan expuestos en esta tabla.

     TABLA I. Análisis químico del agua existente en el interior de San Marcos.
En lo que respecta al actual estado erosivo del sustrato, San Marcos se caracteriza por albergar gran cantidad de sedimentos, que se amontonan en aquellas zonas de poca inclinación donde la escorrentía es menos intensa. En uno de los tubos del extremo sur de la cueva donde la inclinación es mayor, el sustrato dominante es el típico de roca compacta, bien tipo "aa" bien tipo "pahoehce", , En este Lugar , la cantidad de agua también es menor y las escorrentías son raras, lo cual ha favorecido la conservación del impresionante yacimiento de vertebrados fósiles.